有人認為，與傳統的農家肥相比商品有機肥價格高，這種觀點也應理性分析。從數據上看，最近幾年，商品有機肥雖然逐年有所增長，但漲幅均非常平緩。根據中國農資流通協會有機肥分會的統計數據，2011年，國內有機肥產品平均價格是1204元/噸，到2016年1~9月份，這個數字是1366元/噸，六年內，漲幅約160元。這個漲幅大約也僅能抵消六年來原材料、人工、物流費用上升帶來的成本。所以，商品有機肥價格上升是事實，但對于有機肥產業而言，并沒有所謂的暴利存在。

    從產業宏觀層面思考，與國外很多發達國家相比，大力發展商品有機肥某種程度上是中國特色的做法，這與中國的國情農情相契合。發達國家比如美國，因為都是大農場規?；a，需要的有機肥量大而且集中，可以將大量的有機廢棄物在現場進行堆肥處理后直接還田，沒必要經過工業化生產做成商品后再進入市場流通。但中國不同，我們都還是以分散的小農戶為主，土地高度碎片化，加之多年來形成的種植和養殖業的分離，不具備現場大規模堆制有機肥直接還田的條件。最合理的方式，就是做成商品有機肥在市場上銷售，農民根據自身需要自行購買和使用，從而適應了小農生產的特點。

    還需提及的是，目前的商品有機肥與傳統有機肥、國外的堆肥有很大的區別，如今商品有機肥在功能上越來越豐富，集合了有機養分和無機養分的特點，增加了包括土壤改良、提高品質、提升作物抗逆性等在內的諸多功能，實現了計物結合，適應了中國農村勞動力短缺、農民希望輕簡化施肥的實際